Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0H9

Gga1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga1Q8R0H9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gga1Q8R0H9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gga1Q8R0H9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gga1Q8R0H9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gga1Q8R0H9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gga1Q8R0H9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gga1Q8R0H9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gga1Q8R0H9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gga1Q8R0H9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gga1Q8R0H9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gga1Q8R0H9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gga1Q8R0H9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gga1Q8R0H9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gga1Q8R0H9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gga1Q8R0H9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gga1Q8R0H9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gga1Q8R0H9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gga1Q8R0H9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gga1Q8R0H9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gga1Q8R0H9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gga1Q8R0H9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gga1Q8R0H9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gga1Q8R0H9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gga1Q8R0H9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gga1Q8R0H9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms