Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0F3

Sumf1, Sulfatase-modifying factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumf1Q8R0F3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sumf1Q8R0F3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sumf1Q8R0F3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sumf1Q8R0F3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Sumf1Q8R0F3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sumf1Q8R0F3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sumf1Q8R0F3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sumf1Q8R0F3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sumf1Q8R0F3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sumf1Q8R0F3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sumf1Q8R0F3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sumf1Q8R0F3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sumf1Q8R0F3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sumf1Q8R0F3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sumf1Q8R0F3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sumf1Q8R0F3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Sumf1Q8R0F3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Sumf1Q8R0F3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sumf1Q8R0F3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sumf1Q8R0F3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sumf1Q8R0F3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sumf1Q8R0F3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sumf1Q8R0F3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sumf1Q8R0F3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sumf1Q8R0F3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sumf1Q8R0F3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sumf1Q8R0F3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sumf1Q8R0F3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sumf1Q8R0F3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sumf1Q8R0F3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Sumf1Q8R0F3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sumf1Q8R0F3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sumf1Q8R0F3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sumf1Q8R0F3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sumf1Q8R0F3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sumf1Q8R0F3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sumf1Q8R0F3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sumf1Q8R0F3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sumf1Q8R0F3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sumf1Q8R0F3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sumf1Q8R0F3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sumf1Q8R0F3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sumf1Q8R0F3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sumf1Q8R0F3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sumf1Q8R0F3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sumf1Q8R0F3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sumf1Q8R0F3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sumf1Q8R0F3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sumf1Q8R0F3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sumf1Q8R0F3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sumf1Q8R0F3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sumf1Q8R0F3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sumf1Q8R0F3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sumf1Q8R0F3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sumf1Q8R0F3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sumf1Q8R0F3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sumf1Q8R0F3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sumf1Q8R0F3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sumf1Q8R0F3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sumf1Q8R0F3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Sumf1Q8R0F3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Sumf1Q8R0F3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sumf1Q8R0F3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sumf1Q8R0F3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sumf1Q8R0F3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sumf1Q8R0F3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sumf1Q8R0F3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sumf1Q8R0F3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sumf1Q8R0F3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sumf1Q8R0F3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sumf1Q8R0F3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sumf1Q8R0F3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sumf1Q8R0F3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Sumf1Q8R0F3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sumf1Q8R0F3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Sumf1Q8R0F3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sumf1Q8R0F3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sumf1Q8R0F3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sumf1Q8R0F3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sumf1Q8R0F3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sumf1Q8R0F3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sumf1Q8R0F3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sumf1Q8R0F3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sumf1Q8R0F3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Sumf1Q8R0F3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sumf1Q8R0F3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sumf1Q8R0F3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sumf1Q8R0F3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sumf1Q8R0F3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sumf1Q8R0F3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sumf1Q8R0F3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sumf1Q8R0F3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sumf1Q8R0F3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sumf1Q8R0F3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sumf1Q8R0F3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sumf1Q8R0F3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sumf1Q8R0F3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sumf1Q8R0F3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sumf1Q8R0F3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sumf1Q8R0F3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms