Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sf3b4Q8QZY9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms