Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PolbQ8K409 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PolbQ8K409 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PolbQ8K409 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PolbQ8K409 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PolbQ8K409 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PolbQ8K409 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PolbQ8K409 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PolbQ8K409 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PolbQ8K409 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PolbQ8K409 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PolbQ8K409 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PolbQ8K409 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PolbQ8K409 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PolbQ8K409 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PolbQ8K409 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PolbQ8K409 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PolbQ8K409 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PolbQ8K409 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PolbQ8K409 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PolbQ8K409 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PolbQ8K409 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PolbQ8K409 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PolbQ8K409 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PolbQ8K409 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PolbQ8K409 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PolbQ8K409 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PolbQ8K409 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolbQ8K409 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolbQ8K409 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolbQ8K409 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PolbQ8K409 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolbQ8K409 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolbQ8K409 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolbQ8K409 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PolbQ8K409 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PolbQ8K409 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolbQ8K409 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolbQ8K409 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolbQ8K409 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PolbQ8K409 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PolbQ8K409 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PolbQ8K409 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PolbQ8K409 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PolbQ8K409 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PolbQ8K409 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PolbQ8K409 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PolbQ8K409 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PolbQ8K409 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PolbQ8K409 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PolbQ8K409 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PolbQ8K409 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PolbQ8K409 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PolbQ8K409 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PolbQ8K409 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PolbQ8K409 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolbQ8K409 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms