Protein–RNA interactions for Protein: Q8K348

Acvr1c, Activin receptor type-1C, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1cQ8K348 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Acvr1cQ8K348 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Acvr1cQ8K348 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Acvr1cQ8K348 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Acvr1cQ8K348 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Acvr1cQ8K348 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Acvr1cQ8K348 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Acvr1cQ8K348 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Acvr1cQ8K348 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Acvr1cQ8K348 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Acvr1cQ8K348 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Acvr1cQ8K348 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Acvr1cQ8K348 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Acvr1cQ8K348 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Acvr1cQ8K348 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Acvr1cQ8K348 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Acvr1cQ8K348 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms