Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stn1Q8K2X3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stn1Q8K2X3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stn1Q8K2X3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stn1Q8K2X3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stn1Q8K2X3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stn1Q8K2X3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stn1Q8K2X3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stn1Q8K2X3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stn1Q8K2X3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stn1Q8K2X3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stn1Q8K2X3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stn1Q8K2X3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stn1Q8K2X3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stn1Q8K2X3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stn1Q8K2X3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stn1Q8K2X3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stn1Q8K2X3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stn1Q8K2X3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stn1Q8K2X3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stn1Q8K2X3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stn1Q8K2X3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stn1Q8K2X3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stn1Q8K2X3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Stn1Q8K2X3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Stn1Q8K2X3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stn1Q8K2X3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stn1Q8K2X3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms