Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacs1Q8K212 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacs1Q8K212 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacs1Q8K212 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacs1Q8K212 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacs1Q8K212 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacs1Q8K212 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacs1Q8K212 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacs1Q8K212 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacs1Q8K212 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacs1Q8K212 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacs1Q8K212 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacs1Q8K212 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacs1Q8K212 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacs1Q8K212 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacs1Q8K212 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacs1Q8K212 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacs1Q8K212 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacs1Q8K212 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacs1Q8K212 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacs1Q8K212 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacs1Q8K212 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacs1Q8K212 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacs1Q8K212 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacs1Q8K212 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacs1Q8K212 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacs1Q8K212 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacs1Q8K212 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacs1Q8K212 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacs1Q8K212 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacs1Q8K212 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pacs1Q8K212 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pacs1Q8K212 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms