Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
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Cldn34c1Q8K193 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34c1Q8K193 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn34c1Q8K193 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn34c1Q8K193 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn34c1Q8K193 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn34c1Q8K193 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn34c1Q8K193 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn34c1Q8K193 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn34c1Q8K193 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn34c1Q8K193 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn34c1Q8K193 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34c1Q8K193 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34c1Q8K193 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34c1Q8K193 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34c1Q8K193 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34c1Q8K193 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34c1Q8K193 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34c1Q8K193 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34c1Q8K193 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34c1Q8K193 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34c1Q8K193 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34c1Q8K193 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34c1Q8K193 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34c1Q8K193 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn34c1Q8K193 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn34c1Q8K193 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn34c1Q8K193 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn34c1Q8K193 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c1Q8K193 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c1Q8K193 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c1Q8K193 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c1Q8K193 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c1Q8K193 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c1Q8K193 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms