Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZS7

Hmgcll1, 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgcll1Q8JZS7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmgcll1Q8JZS7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmgcll1Q8JZS7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmgcll1Q8JZS7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmgcll1Q8JZS7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hmgcll1Q8JZS7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hmgcll1Q8JZS7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hmgcll1Q8JZS7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmgcll1Q8JZS7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmgcll1Q8JZS7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgcll1Q8JZS7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgcll1Q8JZS7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgcll1Q8JZS7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgcll1Q8JZS7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgcll1Q8JZS7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgcll1Q8JZS7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmgcll1Q8JZS7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hmgcll1Q8JZS7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmgcll1Q8JZS7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmgcll1Q8JZS7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms