Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syne4Q8CII8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syne4Q8CII8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syne4Q8CII8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syne4Q8CII8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syne4Q8CII8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syne4Q8CII8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Syne4Q8CII8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syne4Q8CII8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syne4Q8CII8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syne4Q8CII8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syne4Q8CII8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syne4Q8CII8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syne4Q8CII8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syne4Q8CII8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syne4Q8CII8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syne4Q8CII8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syne4Q8CII8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syne4Q8CII8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Syne4Q8CII8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syne4Q8CII8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syne4Q8CII8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syne4Q8CII8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syne4Q8CII8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syne4Q8CII8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syne4Q8CII8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Syne4Q8CII8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Syne4Q8CII8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syne4Q8CII8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syne4Q8CII8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syne4Q8CII8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syne4Q8CII8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syne4Q8CII8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syne4Q8CII8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syne4Q8CII8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syne4Q8CII8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syne4Q8CII8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syne4Q8CII8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syne4Q8CII8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syne4Q8CII8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syne4Q8CII8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syne4Q8CII8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syne4Q8CII8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syne4Q8CII8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syne4Q8CII8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syne4Q8CII8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Syne4Q8CII8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Syne4Q8CII8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Syne4Q8CII8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Syne4Q8CII8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syne4Q8CII8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms