Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIG3

Kdm1b, Lysine-specific histone demethylase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm1bQ8CIG3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm1bQ8CIG3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm1bQ8CIG3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm1bQ8CIG3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm1bQ8CIG3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm1bQ8CIG3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm1bQ8CIG3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm1bQ8CIG3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm1bQ8CIG3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm1bQ8CIG3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm1bQ8CIG3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm1bQ8CIG3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm1bQ8CIG3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm1bQ8CIG3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm1bQ8CIG3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm1bQ8CIG3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm1bQ8CIG3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Kdm1bQ8CIG3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm1bQ8CIG3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm1bQ8CIG3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm1bQ8CIG3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm1bQ8CIG3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm1bQ8CIG3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm1bQ8CIG3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm1bQ8CIG3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm1bQ8CIG3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm1bQ8CIG3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm1bQ8CIG3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm1bQ8CIG3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm1bQ8CIG3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm1bQ8CIG3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm1bQ8CIG3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm1bQ8CIG3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm1bQ8CIG3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm1bQ8CIG3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm1bQ8CIG3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm1bQ8CIG3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm1bQ8CIG3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm1bQ8CIG3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm1bQ8CIG3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm1bQ8CIG3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm1bQ8CIG3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm1bQ8CIG3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm1bQ8CIG3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm1bQ8CIG3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm1bQ8CIG3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm1bQ8CIG3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm1bQ8CIG3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm1bQ8CIG3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm1bQ8CIG3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm1bQ8CIG3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm1bQ8CIG3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm1bQ8CIG3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm1bQ8CIG3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm1bQ8CIG3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm1bQ8CIG3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm1bQ8CIG3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm1bQ8CIG3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm1bQ8CIG3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms