Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Rab11fip3Q8CHD8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rab11fip3Q8CHD8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rab11fip3Q8CHD8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rab11fip3Q8CHD8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rab11fip3Q8CHD8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rab11fip3Q8CHD8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Rab11fip3Q8CHD8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rab11fip3Q8CHD8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rab11fip3Q8CHD8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rab11fip3Q8CHD8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Rab11fip3Q8CHD8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rab11fip3Q8CHD8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rab11fip3Q8CHD8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rab11fip3Q8CHD8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rab11fip3Q8CHD8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rab11fip3Q8CHD8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rab11fip3Q8CHD8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rab11fip3Q8CHD8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rab11fip3Q8CHD8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rab11fip3Q8CHD8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rab11fip3Q8CHD8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rab11fip3Q8CHD8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rab11fip3Q8CHD8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rab11fip3Q8CHD8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rab11fip3Q8CHD8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rab11fip3Q8CHD8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rab11fip3Q8CHD8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rab11fip3Q8CHD8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rab11fip3Q8CHD8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rab11fip3Q8CHD8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rab11fip3Q8CHD8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rab11fip3Q8CHD8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rab11fip3Q8CHD8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rab11fip3Q8CHD8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rab11fip3Q8CHD8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rab11fip3Q8CHD8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rab11fip3Q8CHD8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rab11fip3Q8CHD8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rab11fip3Q8CHD8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Rab11fip3Q8CHD8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rab11fip3Q8CHD8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rab11fip3Q8CHD8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rab11fip3Q8CHD8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rab11fip3Q8CHD8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rab11fip3Q8CHD8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rab11fip3Q8CHD8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rab11fip3Q8CHD8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rab11fip3Q8CHD8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rab11fip3Q8CHD8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rab11fip3Q8CHD8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rab11fip3Q8CHD8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rab11fip3Q8CHD8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rab11fip3Q8CHD8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rab11fip3Q8CHD8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rab11fip3Q8CHD8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rab11fip3Q8CHD8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rab11fip3Q8CHD8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rab11fip3Q8CHD8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rab11fip3Q8CHD8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rab11fip3Q8CHD8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rab11fip3Q8CHD8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rab11fip3Q8CHD8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rab11fip3Q8CHD8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rab11fip3Q8CHD8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rab11fip3Q8CHD8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rab11fip3Q8CHD8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rab11fip3Q8CHD8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rab11fip3Q8CHD8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rab11fip3Q8CHD8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rab11fip3Q8CHD8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rab11fip3Q8CHD8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rab11fip3Q8CHD8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rab11fip3Q8CHD8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rab11fip3Q8CHD8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rab11fip3Q8CHD8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rab11fip3Q8CHD8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rab11fip3Q8CHD8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rab11fip3Q8CHD8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rab11fip3Q8CHD8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rab11fip3Q8CHD8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rab11fip3Q8CHD8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rab11fip3Q8CHD8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rab11fip3Q8CHD8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms