Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH25

Sltm, SAFB-like transcription modulator, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SltmQ8CH25 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SltmQ8CH25 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SltmQ8CH25 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SltmQ8CH25 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SltmQ8CH25 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SltmQ8CH25 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SltmQ8CH25 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SltmQ8CH25 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SltmQ8CH25 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SltmQ8CH25 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SltmQ8CH25 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SltmQ8CH25 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SltmQ8CH25 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SltmQ8CH25 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SltmQ8CH25 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SltmQ8CH25 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SltmQ8CH25 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SltmQ8CH25 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SltmQ8CH25 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SltmQ8CH25 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SltmQ8CH25 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SltmQ8CH25 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SltmQ8CH25 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SltmQ8CH25 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SltmQ8CH25 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SltmQ8CH25 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SltmQ8CH25 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SltmQ8CH25 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SltmQ8CH25 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SltmQ8CH25 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SltmQ8CH25 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SltmQ8CH25 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SltmQ8CH25 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SltmQ8CH25 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SltmQ8CH25 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SltmQ8CH25 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SltmQ8CH25 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SltmQ8CH25 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SltmQ8CH25 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SltmQ8CH25 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SltmQ8CH25 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SltmQ8CH25 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SltmQ8CH25 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SltmQ8CH25 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SltmQ8CH25 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SltmQ8CH25 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SltmQ8CH25 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SltmQ8CH25 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SltmQ8CH25 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SltmQ8CH25 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SltmQ8CH25 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SltmQ8CH25 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SltmQ8CH25 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SltmQ8CH25 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SltmQ8CH25 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms