Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpc3Q8CFZ4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpc3Q8CFZ4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpc3Q8CFZ4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpc3Q8CFZ4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpc3Q8CFZ4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpc3Q8CFZ4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpc3Q8CFZ4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpc3Q8CFZ4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpc3Q8CFZ4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc3Q8CFZ4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc3Q8CFZ4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc3Q8CFZ4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc3Q8CFZ4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpc3Q8CFZ4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpc3Q8CFZ4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpc3Q8CFZ4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpc3Q8CFZ4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpc3Q8CFZ4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpc3Q8CFZ4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpc3Q8CFZ4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpc3Q8CFZ4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpc3Q8CFZ4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpc3Q8CFZ4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpc3Q8CFZ4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpc3Q8CFZ4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gpc3Q8CFZ4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gpc3Q8CFZ4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpc3Q8CFZ4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpc3Q8CFZ4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpc3Q8CFZ4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpc3Q8CFZ4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpc3Q8CFZ4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpc3Q8CFZ4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpc3Q8CFZ4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpc3Q8CFZ4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpc3Q8CFZ4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpc3Q8CFZ4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpc3Q8CFZ4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpc3Q8CFZ4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpc3Q8CFZ4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpc3Q8CFZ4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpc3Q8CFZ4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpc3Q8CFZ4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpc3Q8CFZ4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpc3Q8CFZ4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpc3Q8CFZ4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpc3Q8CFZ4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpc3Q8CFZ4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpc3Q8CFZ4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpc3Q8CFZ4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gpc3Q8CFZ4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpc3Q8CFZ4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpc3Q8CFZ4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpc3Q8CFZ4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpc3Q8CFZ4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpc3Q8CFZ4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpc3Q8CFZ4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpc3Q8CFZ4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpc3Q8CFZ4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpc3Q8CFZ4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms