Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Setd1bQ8CFT2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Setd1bQ8CFT2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Setd1bQ8CFT2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Setd1bQ8CFT2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Setd1bQ8CFT2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Setd1bQ8CFT2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Setd1bQ8CFT2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Setd1bQ8CFT2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Setd1bQ8CFT2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Setd1bQ8CFT2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Setd1bQ8CFT2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Setd1bQ8CFT2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Setd1bQ8CFT2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Setd1bQ8CFT2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Setd1bQ8CFT2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Setd1bQ8CFT2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Setd1bQ8CFT2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Setd1bQ8CFT2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Setd1bQ8CFT2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Setd1bQ8CFT2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Setd1bQ8CFT2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Setd1bQ8CFT2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Setd1bQ8CFT2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Setd1bQ8CFT2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Setd1bQ8CFT2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Setd1bQ8CFT2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Setd1bQ8CFT2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Setd1bQ8CFT2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Setd1bQ8CFT2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Setd1bQ8CFT2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Setd1bQ8CFT2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Setd1bQ8CFT2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Setd1bQ8CFT2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Setd1bQ8CFT2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Setd1bQ8CFT2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
Setd1bQ8CFT2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Setd1bQ8CFT2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Setd1bQ8CFT2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Setd1bQ8CFT2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Setd1bQ8CFT2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Setd1bQ8CFT2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Setd1bQ8CFT2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Setd1bQ8CFT2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Setd1bQ8CFT2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Setd1bQ8CFT2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Setd1bQ8CFT2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Setd1bQ8CFT2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Setd1bQ8CFT2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Setd1bQ8CFT2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Setd1bQ8CFT2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Setd1bQ8CFT2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Setd1bQ8CFT2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Setd1bQ8CFT2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Setd1bQ8CFT2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Setd1bQ8CFT2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Setd1bQ8CFT2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Setd1bQ8CFT2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Setd1bQ8CFT2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Setd1bQ8CFT2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Setd1bQ8CFT2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Setd1bQ8CFT2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Setd1bQ8CFT2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Setd1bQ8CFT2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Setd1bQ8CFT2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Setd1bQ8CFT2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Setd1bQ8CFT2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Setd1bQ8CFT2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Setd1bQ8CFT2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Setd1bQ8CFT2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Setd1bQ8CFT2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Setd1bQ8CFT2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Setd1bQ8CFT2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Setd1bQ8CFT2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Setd1bQ8CFT2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Setd1bQ8CFT2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Setd1bQ8CFT2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Setd1bQ8CFT2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Setd1bQ8CFT2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Setd1bQ8CFT2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Setd1bQ8CFT2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Setd1bQ8CFT2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Setd1bQ8CFT2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Setd1bQ8CFT2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Setd1bQ8CFT2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Setd1bQ8CFT2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Setd1bQ8CFT2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Setd1bQ8CFT2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Setd1bQ8CFT2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Setd1bQ8CFT2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Setd1bQ8CFT2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Setd1bQ8CFT2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Setd1bQ8CFT2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Setd1bQ8CFT2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Setd1bQ8CFT2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Setd1bQ8CFT2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Setd1bQ8CFT2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Setd1bQ8CFT2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
Setd1bQ8CFT2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Setd1bQ8CFT2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms