Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdkl1Q8CEQ0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdkl1Q8CEQ0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdkl1Q8CEQ0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdkl1Q8CEQ0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdkl1Q8CEQ0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdkl1Q8CEQ0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdkl1Q8CEQ0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdkl1Q8CEQ0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdkl1Q8CEQ0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdkl1Q8CEQ0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdkl1Q8CEQ0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdkl1Q8CEQ0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdkl1Q8CEQ0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdkl1Q8CEQ0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdkl1Q8CEQ0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdkl1Q8CEQ0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdkl1Q8CEQ0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdkl1Q8CEQ0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdkl1Q8CEQ0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdkl1Q8CEQ0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdkl1Q8CEQ0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdkl1Q8CEQ0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdkl1Q8CEQ0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Cdkl1Q8CEQ0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms