Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD15

Riox2, Ribosomal oxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox2Q8CD15 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Riox2Q8CD15 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Riox2Q8CD15 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Riox2Q8CD15 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Riox2Q8CD15 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Riox2Q8CD15 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Riox2Q8CD15 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Riox2Q8CD15 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Riox2Q8CD15 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Riox2Q8CD15 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Riox2Q8CD15 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Riox2Q8CD15 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Riox2Q8CD15 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Riox2Q8CD15 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Riox2Q8CD15 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Riox2Q8CD15 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Riox2Q8CD15 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Riox2Q8CD15 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Riox2Q8CD15 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Riox2Q8CD15 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Riox2Q8CD15 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Riox2Q8CD15 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Riox2Q8CD15 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Riox2Q8CD15 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Riox2Q8CD15 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Riox2Q8CD15 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Riox2Q8CD15 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Riox2Q8CD15 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Riox2Q8CD15 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms