Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ufl1Q8CCJ3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ufl1Q8CCJ3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ufl1Q8CCJ3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ufl1Q8CCJ3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ufl1Q8CCJ3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ufl1Q8CCJ3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ufl1Q8CCJ3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ufl1Q8CCJ3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ufl1Q8CCJ3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ufl1Q8CCJ3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ufl1Q8CCJ3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ufl1Q8CCJ3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ufl1Q8CCJ3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ufl1Q8CCJ3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ufl1Q8CCJ3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ufl1Q8CCJ3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ufl1Q8CCJ3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ufl1Q8CCJ3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ufl1Q8CCJ3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ufl1Q8CCJ3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ufl1Q8CCJ3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ufl1Q8CCJ3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ufl1Q8CCJ3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ufl1Q8CCJ3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ufl1Q8CCJ3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms