Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms