Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCB4

Vps53, Vacuolar protein sorting-associated protein 53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps53Q8CCB4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vps53Q8CCB4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vps53Q8CCB4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vps53Q8CCB4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vps53Q8CCB4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps53Q8CCB4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps53Q8CCB4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps53Q8CCB4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps53Q8CCB4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps53Q8CCB4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps53Q8CCB4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps53Q8CCB4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps53Q8CCB4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps53Q8CCB4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps53Q8CCB4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps53Q8CCB4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps53Q8CCB4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps53Q8CCB4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps53Q8CCB4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps53Q8CCB4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps53Q8CCB4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps53Q8CCB4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps53Q8CCB4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps53Q8CCB4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps53Q8CCB4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps53Q8CCB4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps53Q8CCB4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps53Q8CCB4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps53Q8CCB4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps53Q8CCB4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps53Q8CCB4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps53Q8CCB4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps53Q8CCB4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps53Q8CCB4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps53Q8CCB4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps53Q8CCB4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps53Q8CCB4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps53Q8CCB4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps53Q8CCB4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps53Q8CCB4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps53Q8CCB4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms