Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6B2

Rtkn, Rhotekin, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtknQ8C6B2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RtknQ8C6B2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RtknQ8C6B2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RtknQ8C6B2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RtknQ8C6B2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RtknQ8C6B2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RtknQ8C6B2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RtknQ8C6B2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RtknQ8C6B2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RtknQ8C6B2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RtknQ8C6B2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RtknQ8C6B2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RtknQ8C6B2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RtknQ8C6B2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RtknQ8C6B2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RtknQ8C6B2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RtknQ8C6B2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RtknQ8C6B2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RtknQ8C6B2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RtknQ8C6B2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RtknQ8C6B2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RtknQ8C6B2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RtknQ8C6B2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RtknQ8C6B2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RtknQ8C6B2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RtknQ8C6B2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RtknQ8C6B2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RtknQ8C6B2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RtknQ8C6B2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RtknQ8C6B2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RtknQ8C6B2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RtknQ8C6B2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RtknQ8C6B2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RtknQ8C6B2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RtknQ8C6B2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RtknQ8C6B2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RtknQ8C6B2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RtknQ8C6B2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RtknQ8C6B2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RtknQ8C6B2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RtknQ8C6B2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RtknQ8C6B2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RtknQ8C6B2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RtknQ8C6B2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RtknQ8C6B2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RtknQ8C6B2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RtknQ8C6B2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RtknQ8C6B2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RtknQ8C6B2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms