Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q8C1R3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q8C1R3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q8C1R3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q8C1R3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q8C1R3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8C1R3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8C1R3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8C1R3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q8C1R3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q8C1R3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q8C1R3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q8C1R3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q8C1R3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8C1R3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8C1R3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8C1R3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8C1R3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8C1R3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8C1R3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8C1R3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8C1R3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Q8C1R3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8C1R3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8C1R3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms