Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0D0

Trub1, Probable tRNA pseudouridine synthase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub1Q8C0D0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trub1Q8C0D0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trub1Q8C0D0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trub1Q8C0D0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trub1Q8C0D0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trub1Q8C0D0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trub1Q8C0D0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trub1Q8C0D0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trub1Q8C0D0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trub1Q8C0D0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trub1Q8C0D0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trub1Q8C0D0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trub1Q8C0D0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trub1Q8C0D0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trub1Q8C0D0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trub1Q8C0D0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trub1Q8C0D0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trub1Q8C0D0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trub1Q8C0D0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trub1Q8C0D0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trub1Q8C0D0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trub1Q8C0D0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trub1Q8C0D0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trub1Q8C0D0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trub1Q8C0D0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trub1Q8C0D0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trub1Q8C0D0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms