Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rdh12Q8BYK4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rdh12Q8BYK4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rdh12Q8BYK4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rdh12Q8BYK4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rdh12Q8BYK4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rdh12Q8BYK4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rdh12Q8BYK4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rdh12Q8BYK4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rdh12Q8BYK4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdh12Q8BYK4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdh12Q8BYK4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdh12Q8BYK4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdh12Q8BYK4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdh12Q8BYK4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdh12Q8BYK4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdh12Q8BYK4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdh12Q8BYK4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdh12Q8BYK4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdh12Q8BYK4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdh12Q8BYK4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdh12Q8BYK4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdh12Q8BYK4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdh12Q8BYK4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdh12Q8BYK4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdh12Q8BYK4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdh12Q8BYK4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdh12Q8BYK4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdh12Q8BYK4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdh12Q8BYK4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms