Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnrQ8BYI9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TnrQ8BYI9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TnrQ8BYI9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TnrQ8BYI9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TnrQ8BYI9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TnrQ8BYI9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TnrQ8BYI9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TnrQ8BYI9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TnrQ8BYI9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TnrQ8BYI9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TnrQ8BYI9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TnrQ8BYI9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TnrQ8BYI9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TnrQ8BYI9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TnrQ8BYI9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TnrQ8BYI9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TnrQ8BYI9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TnrQ8BYI9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TnrQ8BYI9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TnrQ8BYI9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TnrQ8BYI9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TnrQ8BYI9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TnrQ8BYI9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TnrQ8BYI9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TnrQ8BYI9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TnrQ8BYI9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TnrQ8BYI9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TnrQ8BYI9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TnrQ8BYI9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TnrQ8BYI9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TnrQ8BYI9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TnrQ8BYI9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TnrQ8BYI9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TnrQ8BYI9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TnrQ8BYI9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TnrQ8BYI9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TnrQ8BYI9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TnrQ8BYI9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TnrQ8BYI9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TnrQ8BYI9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TnrQ8BYI9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TnrQ8BYI9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TnrQ8BYI9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TnrQ8BYI9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TnrQ8BYI9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TnrQ8BYI9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TnrQ8BYI9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TnrQ8BYI9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TnrQ8BYI9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TnrQ8BYI9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TnrQ8BYI9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TnrQ8BYI9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TnrQ8BYI9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TnrQ8BYI9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TnrQ8BYI9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TnrQ8BYI9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TnrQ8BYI9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TnrQ8BYI9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TnrQ8BYI9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TnrQ8BYI9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TnrQ8BYI9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TnrQ8BYI9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TnrQ8BYI9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TnrQ8BYI9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TnrQ8BYI9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TnrQ8BYI9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TnrQ8BYI9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TnrQ8BYI9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TnrQ8BYI9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TnrQ8BYI9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TnrQ8BYI9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TnrQ8BYI9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TnrQ8BYI9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TnrQ8BYI9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TnrQ8BYI9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TnrQ8BYI9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TnrQ8BYI9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TnrQ8BYI9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TnrQ8BYI9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TnrQ8BYI9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TnrQ8BYI9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TnrQ8BYI9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TnrQ8BYI9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TnrQ8BYI9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TnrQ8BYI9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TnrQ8BYI9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TnrQ8BYI9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TnrQ8BYI9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TnrQ8BYI9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TnrQ8BYI9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TnrQ8BYI9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TnrQ8BYI9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TnrQ8BYI9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TnrQ8BYI9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TnrQ8BYI9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TnrQ8BYI9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TnrQ8BYI9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TnrQ8BYI9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TnrQ8BYI9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TnrQ8BYI9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms