Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXN7

Ppm1k, Protein phosphatase 1K, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1kQ8BXN7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppm1kQ8BXN7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppm1kQ8BXN7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppm1kQ8BXN7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppm1kQ8BXN7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppm1kQ8BXN7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppm1kQ8BXN7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppm1kQ8BXN7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppm1kQ8BXN7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppm1kQ8BXN7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppm1kQ8BXN7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppm1kQ8BXN7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppm1kQ8BXN7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppm1kQ8BXN7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppm1kQ8BXN7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppm1kQ8BXN7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppm1kQ8BXN7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppm1kQ8BXN7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppm1kQ8BXN7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppm1kQ8BXN7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppm1kQ8BXN7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppm1kQ8BXN7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppm1kQ8BXN7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppm1kQ8BXN7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppm1kQ8BXN7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppm1kQ8BXN7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppm1kQ8BXN7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppm1kQ8BXN7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppm1kQ8BXN7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppm1kQ8BXN7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppm1kQ8BXN7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppm1kQ8BXN7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppm1kQ8BXN7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppm1kQ8BXN7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppm1kQ8BXN7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppm1kQ8BXN7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppm1kQ8BXN7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppm1kQ8BXN7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppm1kQ8BXN7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppm1kQ8BXN7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppm1kQ8BXN7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppm1kQ8BXN7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppm1kQ8BXN7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppm1kQ8BXN7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppm1kQ8BXN7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppm1kQ8BXN7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppm1kQ8BXN7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppm1kQ8BXN7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppm1kQ8BXN7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppm1kQ8BXN7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppm1kQ8BXN7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppm1kQ8BXN7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppm1kQ8BXN7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppm1kQ8BXN7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppm1kQ8BXN7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppm1kQ8BXN7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppm1kQ8BXN7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppm1kQ8BXN7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms