Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Pggt1bQ8BUY9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Pggt1bQ8BUY9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pggt1bQ8BUY9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pggt1bQ8BUY9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pggt1bQ8BUY9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pggt1bQ8BUY9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pggt1bQ8BUY9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pggt1bQ8BUY9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Pggt1bQ8BUY9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pggt1bQ8BUY9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Pggt1bQ8BUY9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pggt1bQ8BUY9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Pggt1bQ8BUY9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pggt1bQ8BUY9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Pggt1bQ8BUY9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pggt1bQ8BUY9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pggt1bQ8BUY9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pggt1bQ8BUY9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pggt1bQ8BUY9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pggt1bQ8BUY9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Pggt1bQ8BUY9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pggt1bQ8BUY9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pggt1bQ8BUY9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pggt1bQ8BUY9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pggt1bQ8BUY9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pggt1bQ8BUY9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pggt1bQ8BUY9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pggt1bQ8BUY9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pggt1bQ8BUY9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pggt1bQ8BUY9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pggt1bQ8BUY9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pggt1bQ8BUY9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pggt1bQ8BUY9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pggt1bQ8BUY9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pggt1bQ8BUY9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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