Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTF7

Lig4, DNA ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig4Q8BTF7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig4Q8BTF7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms