Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLY1

Smoc1, SPARC-related modular calcium-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smoc1Q8BLY1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smoc1Q8BLY1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smoc1Q8BLY1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smoc1Q8BLY1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smoc1Q8BLY1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smoc1Q8BLY1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smoc1Q8BLY1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smoc1Q8BLY1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smoc1Q8BLY1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smoc1Q8BLY1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smoc1Q8BLY1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smoc1Q8BLY1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smoc1Q8BLY1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smoc1Q8BLY1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smoc1Q8BLY1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smoc1Q8BLY1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smoc1Q8BLY1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 201.2 ms