Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tspan12Q8BKT6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms