Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW1

Prune1, Exopolyphosphatase PRUNE1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune1Q8BIW1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prune1Q8BIW1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prune1Q8BIW1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prune1Q8BIW1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prune1Q8BIW1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prune1Q8BIW1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prune1Q8BIW1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prune1Q8BIW1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prune1Q8BIW1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prune1Q8BIW1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prune1Q8BIW1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prune1Q8BIW1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prune1Q8BIW1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prune1Q8BIW1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prune1Q8BIW1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prune1Q8BIW1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prune1Q8BIW1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prune1Q8BIW1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prune1Q8BIW1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prune1Q8BIW1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prune1Q8BIW1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prune1Q8BIW1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prune1Q8BIW1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prune1Q8BIW1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prune1Q8BIW1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Prune1Q8BIW1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prune1Q8BIW1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prune1Q8BIW1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prune1Q8BIW1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prune1Q8BIW1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prune1Q8BIW1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prune1Q8BIW1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prune1Q8BIW1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Prune1Q8BIW1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prune1Q8BIW1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms