Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIG4

Fbxo28, F-box only protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo28Q8BIG4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fbxo28Q8BIG4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo28Q8BIG4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo28Q8BIG4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo28Q8BIG4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo28Q8BIG4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo28Q8BIG4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo28Q8BIG4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo28Q8BIG4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo28Q8BIG4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo28Q8BIG4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo28Q8BIG4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo28Q8BIG4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo28Q8BIG4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbxo28Q8BIG4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbxo28Q8BIG4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbxo28Q8BIG4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo28Q8BIG4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo28Q8BIG4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo28Q8BIG4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo28Q8BIG4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo28Q8BIG4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo28Q8BIG4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo28Q8BIG4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo28Q8BIG4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo28Q8BIG4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo28Q8BIG4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo28Q8BIG4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo28Q8BIG4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo28Q8BIG4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo28Q8BIG4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo28Q8BIG4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo28Q8BIG4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms