Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf41Q8BH75 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf41Q8BH75 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf41Q8BH75 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf41Q8BH75 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf41Q8BH75 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf41Q8BH75 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf41Q8BH75 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf41Q8BH75 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf41Q8BH75 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnf41Q8BH75 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnf41Q8BH75 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnf41Q8BH75 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf41Q8BH75 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf41Q8BH75 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf41Q8BH75 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf41Q8BH75 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf41Q8BH75 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf41Q8BH75 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf41Q8BH75 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf41Q8BH75 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf41Q8BH75 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf41Q8BH75 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf41Q8BH75 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf41Q8BH75 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf41Q8BH75 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rnf41Q8BH75 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf41Q8BH75 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rnf41Q8BH75 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rnf41Q8BH75 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rnf41Q8BH75 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rnf41Q8BH75 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rnf41Q8BH75 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf41Q8BH75 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf41Q8BH75 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf41Q8BH75 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf41Q8BH75 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf41Q8BH75 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf41Q8BH75 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf41Q8BH75 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf41Q8BH75 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf41Q8BH75 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf41Q8BH75 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf41Q8BH75 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf41Q8BH75 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf41Q8BH75 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf41Q8BH75 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf41Q8BH75 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf41Q8BH75 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf41Q8BH75 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf41Q8BH75 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf41Q8BH75 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf41Q8BH75 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rnf41Q8BH75 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.7 ms