Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Best2Q8BGM5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms