Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc38a9Q8BGD6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc38a9Q8BGD6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc38a9Q8BGD6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms