Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnpo1Q8BFY9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnpo1Q8BFY9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tnpo1Q8BFY9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms