Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z37

Topors, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ToporsQ80Z37 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ToporsQ80Z37 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ToporsQ80Z37 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ToporsQ80Z37 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ToporsQ80Z37 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ToporsQ80Z37 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ToporsQ80Z37 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ToporsQ80Z37 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ToporsQ80Z37 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ToporsQ80Z37 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ToporsQ80Z37 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ToporsQ80Z37 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ToporsQ80Z37 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ToporsQ80Z37 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ToporsQ80Z37 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ToporsQ80Z37 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ToporsQ80Z37 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ToporsQ80Z37 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ToporsQ80Z37 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ToporsQ80Z37 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms