Protein–RNA interactions for Protein: Q80WV7

Srrm3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm3Q80WV7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srrm3Q80WV7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Srrm3Q80WV7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Srrm3Q80WV7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srrm3Q80WV7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srrm3Q80WV7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srrm3Q80WV7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srrm3Q80WV7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srrm3Q80WV7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Srrm3Q80WV7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srrm3Q80WV7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srrm3Q80WV7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Srrm3Q80WV7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Srrm3Q80WV7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srrm3Q80WV7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srrm3Q80WV7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srrm3Q80WV7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Srrm3Q80WV7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srrm3Q80WV7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srrm3Q80WV7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srrm3Q80WV7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srrm3Q80WV7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srrm3Q80WV7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srrm3Q80WV7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srrm3Q80WV7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srrm3Q80WV7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srrm3Q80WV7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srrm3Q80WV7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srrm3Q80WV7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srrm3Q80WV7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srrm3Q80WV7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srrm3Q80WV7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srrm3Q80WV7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srrm3Q80WV7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Srrm3Q80WV7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srrm3Q80WV7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms