Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG2

Plxna4, Plexin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna4Q80UG2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Plxna4Q80UG2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Plxna4Q80UG2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plxna4Q80UG2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plxna4Q80UG2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plxna4Q80UG2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plxna4Q80UG2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plxna4Q80UG2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plxna4Q80UG2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Plxna4Q80UG2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Plxna4Q80UG2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Plxna4Q80UG2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Plxna4Q80UG2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Plxna4Q80UG2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Plxna4Q80UG2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Plxna4Q80UG2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Plxna4Q80UG2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Plxna4Q80UG2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Plxna4Q80UG2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Plxna4Q80UG2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Plxna4Q80UG2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Plxna4Q80UG2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Plxna4Q80UG2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Plxna4Q80UG2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Plxna4Q80UG2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Plxna4Q80UG2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Plxna4Q80UG2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Plxna4Q80UG2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms