Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Cep170bQ80U49 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cep170bQ80U49 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cep170bQ80U49 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cep170bQ80U49 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cep170bQ80U49 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cep170bQ80U49 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cep170bQ80U49 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cep170bQ80U49 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cep170bQ80U49 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cep170bQ80U49 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cep170bQ80U49 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cep170bQ80U49 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cep170bQ80U49 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cep170bQ80U49 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cep170bQ80U49 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cep170bQ80U49 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cep170bQ80U49 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cep170bQ80U49 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cep170bQ80U49 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cep170bQ80U49 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cep170bQ80U49 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cep170bQ80U49 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cep170bQ80U49 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cep170bQ80U49 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cep170bQ80U49 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cep170bQ80U49 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cep170bQ80U49 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cep170bQ80U49 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cep170bQ80U49 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cep170bQ80U49 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Cep170bQ80U49 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cep170bQ80U49 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cep170bQ80U49 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cep170bQ80U49 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cep170bQ80U49 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cep170bQ80U49 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cep170bQ80U49 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cep170bQ80U49 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cep170bQ80U49 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cep170bQ80U49 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Cep170bQ80U49 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cep170bQ80U49 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cep170bQ80U49 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cep170bQ80U49 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cep170bQ80U49 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cep170bQ80U49 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cep170bQ80U49 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cep170bQ80U49 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cep170bQ80U49 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Cep170bQ80U49 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cep170bQ80U49 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cep170bQ80U49 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cep170bQ80U49 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Cep170bQ80U49 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Cep170bQ80U49 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cep170bQ80U49 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cep170bQ80U49 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cep170bQ80U49 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cep170bQ80U49 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cep170bQ80U49 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cep170bQ80U49 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cep170bQ80U49 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cep170bQ80U49 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cep170bQ80U49 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cep170bQ80U49 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.1 ms