Protein–RNA interactions for Protein: Q80TR4

Slit1, Slit homolog 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit1Q80TR4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slit1Q80TR4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slit1Q80TR4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slit1Q80TR4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slit1Q80TR4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slit1Q80TR4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slit1Q80TR4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slit1Q80TR4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slit1Q80TR4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slit1Q80TR4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slit1Q80TR4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slit1Q80TR4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slit1Q80TR4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slit1Q80TR4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Slit1Q80TR4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Slit1Q80TR4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slit1Q80TR4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slit1Q80TR4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slit1Q80TR4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slit1Q80TR4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slit1Q80TR4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slit1Q80TR4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slit1Q80TR4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Slit1Q80TR4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slit1Q80TR4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slit1Q80TR4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slit1Q80TR4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slit1Q80TR4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Slit1Q80TR4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slit1Q80TR4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slit1Q80TR4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slit1Q80TR4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slit1Q80TR4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slit1Q80TR4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slit1Q80TR4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slit1Q80TR4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slit1Q80TR4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slit1Q80TR4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slit1Q80TR4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slit1Q80TR4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slit1Q80TR4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slit1Q80TR4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slit1Q80TR4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slit1Q80TR4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slit1Q80TR4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slit1Q80TR4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slit1Q80TR4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slit1Q80TR4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Slit1Q80TR4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slit1Q80TR4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Slit1Q80TR4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slit1Q80TR4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slit1Q80TR4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slit1Q80TR4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slit1Q80TR4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Slit1Q80TR4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slit1Q80TR4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slit1Q80TR4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slit1Q80TR4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slit1Q80TR4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slit1Q80TR4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slit1Q80TR4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slit1Q80TR4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slit1Q80TR4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slit1Q80TR4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slit1Q80TR4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slit1Q80TR4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slit1Q80TR4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slit1Q80TR4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Slit1Q80TR4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slit1Q80TR4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slit1Q80TR4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Slit1Q80TR4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms