Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI3

Ppp6r1, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6r1Q7TSI3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ppp6r1Q7TSI3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ppp6r1Q7TSI3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ppp6r1Q7TSI3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ppp6r1Q7TSI3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ppp6r1Q7TSI3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ppp6r1Q7TSI3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppp6r1Q7TSI3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppp6r1Q7TSI3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppp6r1Q7TSI3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppp6r1Q7TSI3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppp6r1Q7TSI3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppp6r1Q7TSI3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppp6r1Q7TSI3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ppp6r1Q7TSI3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ppp6r1Q7TSI3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ppp6r1Q7TSI3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ppp6r1Q7TSI3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppp6r1Q7TSI3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppp6r1Q7TSI3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppp6r1Q7TSI3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppp6r1Q7TSI3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppp6r1Q7TSI3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ppp6r1Q7TSI3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ppp6r1Q7TSI3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ppp6r1Q7TSI3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppp6r1Q7TSI3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppp6r1Q7TSI3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms