Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Prrc2bQ7TPM1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Prrc2bQ7TPM1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Prrc2bQ7TPM1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Prrc2bQ7TPM1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Prrc2bQ7TPM1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Prrc2bQ7TPM1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Prrc2bQ7TPM1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Prrc2bQ7TPM1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Prrc2bQ7TPM1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Prrc2bQ7TPM1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Prrc2bQ7TPM1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Prrc2bQ7TPM1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Prrc2bQ7TPM1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Prrc2bQ7TPM1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Prrc2bQ7TPM1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Prrc2bQ7TPM1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Prrc2bQ7TPM1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Prrc2bQ7TPM1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Prrc2bQ7TPM1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Prrc2bQ7TPM1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Prrc2bQ7TPM1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Prrc2bQ7TPM1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Prrc2bQ7TPM1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Prrc2bQ7TPM1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Prrc2bQ7TPM1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Prrc2bQ7TPM1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Prrc2bQ7TPM1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Prrc2bQ7TPM1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Prrc2bQ7TPM1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Prrc2bQ7TPM1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Prrc2bQ7TPM1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Prrc2bQ7TPM1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Prrc2bQ7TPM1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Prrc2bQ7TPM1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Prrc2bQ7TPM1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Prrc2bQ7TPM1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Prrc2bQ7TPM1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Prrc2bQ7TPM1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Prrc2bQ7TPM1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Prrc2bQ7TPM1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Prrc2bQ7TPM1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Prrc2bQ7TPM1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Prrc2bQ7TPM1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Prrc2bQ7TPM1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Prrc2bQ7TPM1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Prrc2bQ7TPM1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Prrc2bQ7TPM1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Prrc2bQ7TPM1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Prrc2bQ7TPM1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Prrc2bQ7TPM1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Prrc2bQ7TPM1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Prrc2bQ7TPM1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Prrc2bQ7TPM1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Prrc2bQ7TPM1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Prrc2bQ7TPM1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Prrc2bQ7TPM1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Prrc2bQ7TPM1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Prrc2bQ7TPM1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Prrc2bQ7TPM1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Prrc2bQ7TPM1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Prrc2bQ7TPM1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Prrc2bQ7TPM1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Prrc2bQ7TPM1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Prrc2bQ7TPM1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Prrc2bQ7TPM1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Prrc2bQ7TPM1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Prrc2bQ7TPM1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Prrc2bQ7TPM1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Prrc2bQ7TPM1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Prrc2bQ7TPM1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Prrc2bQ7TPM1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Prrc2bQ7TPM1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Prrc2bQ7TPM1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Prrc2bQ7TPM1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Prrc2bQ7TPM1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Prrc2bQ7TPM1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Prrc2bQ7TPM1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Prrc2bQ7TPM1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Prrc2bQ7TPM1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Prrc2bQ7TPM1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Prrc2bQ7TPM1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Prrc2bQ7TPM1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Prrc2bQ7TPM1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Prrc2bQ7TPM1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Prrc2bQ7TPM1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Prrc2bQ7TPM1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Prrc2bQ7TPM1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Prrc2bQ7TPM1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Prrc2bQ7TPM1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Prrc2bQ7TPM1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Prrc2bQ7TPM1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Prrc2bQ7TPM1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Prrc2bQ7TPM1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Prrc2bQ7TPM1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Prrc2bQ7TPM1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms