Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL3

Stk40, Serine/threonine-protein kinase 40, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk40Q7TNL3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stk40Q7TNL3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stk40Q7TNL3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stk40Q7TNL3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stk40Q7TNL3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stk40Q7TNL3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stk40Q7TNL3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stk40Q7TNL3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stk40Q7TNL3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Stk40Q7TNL3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stk40Q7TNL3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stk40Q7TNL3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stk40Q7TNL3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stk40Q7TNL3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stk40Q7TNL3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stk40Q7TNL3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stk40Q7TNL3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms