Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nphp3Q7TNH6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nphp3Q7TNH6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nphp3Q7TNH6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nphp3Q7TNH6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nphp3Q7TNH6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nphp3Q7TNH6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nphp3Q7TNH6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nphp3Q7TNH6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nphp3Q7TNH6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nphp3Q7TNH6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nphp3Q7TNH6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nphp3Q7TNH6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nphp3Q7TNH6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nphp3Q7TNH6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nphp3Q7TNH6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Nphp3Q7TNH6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nphp3Q7TNH6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nphp3Q7TNH6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nphp3Q7TNH6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nphp3Q7TNH6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nphp3Q7TNH6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nphp3Q7TNH6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Nphp3Q7TNH6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nphp3Q7TNH6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nphp3Q7TNH6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nphp3Q7TNH6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nphp3Q7TNH6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nphp3Q7TNH6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nphp3Q7TNH6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nphp3Q7TNH6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nphp3Q7TNH6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nphp3Q7TNH6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nphp3Q7TNH6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nphp3Q7TNH6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nphp3Q7TNH6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nphp3Q7TNH6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nphp3Q7TNH6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nphp3Q7TNH6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nphp3Q7TNH6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms