Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNG8

Ldhd, Probable D-lactate dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdhdQ7TNG8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LdhdQ7TNG8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LdhdQ7TNG8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LdhdQ7TNG8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LdhdQ7TNG8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LdhdQ7TNG8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LdhdQ7TNG8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LdhdQ7TNG8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LdhdQ7TNG8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LdhdQ7TNG8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LdhdQ7TNG8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LdhdQ7TNG8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LdhdQ7TNG8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LdhdQ7TNG8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LdhdQ7TNG8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LdhdQ7TNG8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LdhdQ7TNG8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LdhdQ7TNG8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LdhdQ7TNG8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LdhdQ7TNG8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LdhdQ7TNG8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LdhdQ7TNG8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LdhdQ7TNG8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LdhdQ7TNG8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LdhdQ7TNG8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LdhdQ7TNG8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LdhdQ7TNG8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LdhdQ7TNG8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LdhdQ7TNG8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
LdhdQ7TNG8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LdhdQ7TNG8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LdhdQ7TNG8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LdhdQ7TNG8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LdhdQ7TNG8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LdhdQ7TNG8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LdhdQ7TNG8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LdhdQ7TNG8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LdhdQ7TNG8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LdhdQ7TNG8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LdhdQ7TNG8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LdhdQ7TNG8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LdhdQ7TNG8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LdhdQ7TNG8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LdhdQ7TNG8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LdhdQ7TNG8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LdhdQ7TNG8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LdhdQ7TNG8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LdhdQ7TNG8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LdhdQ7TNG8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LdhdQ7TNG8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LdhdQ7TNG8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LdhdQ7TNG8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LdhdQ7TNG8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LdhdQ7TNG8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LdhdQ7TNG8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LdhdQ7TNG8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LdhdQ7TNG8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LdhdQ7TNG8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LdhdQ7TNG8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LdhdQ7TNG8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LdhdQ7TNG8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms