Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkd1l2Q7TN88 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkd1l2Q7TN88 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkd1l2Q7TN88 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkd1l2Q7TN88 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkd1l2Q7TN88 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Pkd1l2Q7TN88 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkd1l2Q7TN88 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms