Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smap2Q7TN29 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.7 ms