Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMB8

Cyfip1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip1Q7TMB8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyfip1Q7TMB8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyfip1Q7TMB8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyfip1Q7TMB8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyfip1Q7TMB8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyfip1Q7TMB8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyfip1Q7TMB8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyfip1Q7TMB8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyfip1Q7TMB8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyfip1Q7TMB8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyfip1Q7TMB8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyfip1Q7TMB8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyfip1Q7TMB8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyfip1Q7TMB8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyfip1Q7TMB8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyfip1Q7TMB8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyfip1Q7TMB8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyfip1Q7TMB8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyfip1Q7TMB8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyfip1Q7TMB8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyfip1Q7TMB8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyfip1Q7TMB8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyfip1Q7TMB8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyfip1Q7TMB8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyfip1Q7TMB8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyfip1Q7TMB8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyfip1Q7TMB8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyfip1Q7TMB8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyfip1Q7TMB8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyfip1Q7TMB8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyfip1Q7TMB8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyfip1Q7TMB8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyfip1Q7TMB8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyfip1Q7TMB8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyfip1Q7TMB8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyfip1Q7TMB8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cyfip1Q7TMB8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms