Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ScocQ78YZ6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ScocQ78YZ6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
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